Энергия тела  — жизненная сила, произведённая из клеток живых организмов, полученная благодаря тренировкам и жизненному опыту. Объединяя её с духовной энергией (силой воли), можно добиться сверхчеловеческой выносливости, используемой в тайдзюцу или сформировать энергию называемую чакра , основу даже самого элементарного дзюцу.

Однажды образовавшись, энергия направляется по системе циркуляции чакры (которая аналогична системе циркуляции крови) к любому из 361 выхода на теле человека. Это происходит благодаря различным методам, из которых самый используемый — это особое положение пальцев и кистей рук, дающее возможность управлять чакрой и добиваться эффектов, которые иначе не были бы достигнуты (например, ходьба по воде или выдыхание огня). В контексте восточной философии военного искусства, чакра равнозначна Ци (Ки).

В зависимости от соотношения смешанной физической и духовной энергии, могут быть сформированы различные типы чакры. Простейшая чакра, использующаяся для фундаментальных дзюцу — самый распространённый продукт этого. Кроме того, чакра большинства ниндзя включает в себя элемент одной из пяти природных стихий (по очереди: огонь, ветер, молния, земля и вода), хотя были случаи, когда такой обладатель имел возможность создать второй компонент, отличный от собственного. Каждый элемент превосходит по силе последующий и слаб против предыдущего (например, ветер слаб против огня и эффективен против молнии). Вдобавок, каждой стихийной технике может противостоять равное или более мощное дзюцу с таким же элементом.
Немногие кэккэй гэнкай через смесь основных стихий могут создавать уникальные элементы, типа дерева (земля+вода) или льда (ветер+вода). В тоже время, некоторые ниндзя, овладевшие двумя типами чакры, не в состоянии объединить их. Также Ямато упоминает о светлой и тёмной чакре, но не уточняет, для чего они нужны. Дзирайя же говорит об чакре инь и ян, которая принадлежит Девятихвостому Демону.

Типы чакры:

http://i069.radikal.ru/0809/9f/1f04a18b78e2.gif Обычная чакра. Такой пользуються все и такая нужна для использования любого дзюцу.

http://s48.radikal.ru/i122/0809/2e/1369e38808fa.gif Такая чакра появляеться, когда шиноби использует медицинское ниндзюцу.

http://i013.radikal.ru/0809/43/6de53e0bbad9.gif Эта чакра используеться при открытии Небесных Врат.

http://s59.radikal.ru/i163/0809/e1/3df4149c88fa.gif [url=http://www.radikal.ru]Чакра Печати Орочимару появлеться при использовании этой печати.

http://i008.radikal.ru/0809/33/4858713c565d.gif Самая страшная и опасная чакра - чакра Девятихвостого Демона-Лиса. Она появляеться у Наруто, когда он обращяеться к силе этого монстра